ويأتي من أبرز مستهدفات أكاديمية الزكاة والضريبة والجمارك، سعيها إلى تقديم أسلوب فريد ومميز لضمان التعلم والتطوير المستمر لموظفي الهيئة، وإعدادهم بالمعارف والمهارات اللازمة، التي تضمن التطوير المهني المستمر، وتأهيل القادة بالمهارات القيادية، إلى جانب تقديم الاستشارات المهنية، وتطوير المستوى المعرفي للمهتمين في مجالات الزكاة والضريبة والجمارك.
وتقدم الأكاديمية العديد من البرامج والخدمات، من أبرزها برامج التطوير السلوكية، والقيادية، والفنية، وبرامج دعم الشهادات المهنية، والتعلم الإلكتروني، وبرامج تطوير اللغة الإنجليزية، بالإضافة إلى الزيارات الميدانية إلى بيوت الخبرة العالمية، والمؤتمرات المتخصصة، ويستفيد من ذلك منسوبي الهيئة والفئات المستهدفة من خارجها على المستويين المحلي والإقليمي.
ويأتي افتتاح أكاديمية الهيئة على هامش انعقاد أعمال مؤتمر الزكاة والضريبة والجمارك الذي تُنظمه الهيئة بمشاركة أكثر من 50 متحدثًا من مختلف بلدان العالم، ويضم 15 جلسة حوارية وورقة عمل تناقش جميعها مجالات العمل الزكوي والضريبي والجمركي، بالإضافة إلى المعرض المصاحب الذي تشارك به أكثر من 50 جهة من القطاعين العام والخاص.